Covid-19 : en cas de test positif, comment savoir si l’on est contaminé par un variant ?

02/03/2021

On le sait : les variants du Sars-CoV-2 gagnent du terrain en France. Certains patients se demandent donc s’ils sont atteints de la souche classique ou de la mutation du virus. Comment obtenir cette information ?

Entre 15 et 20 % de variants du virus Sars-CoV-2 ont été identifiés parmi les cas positifs recensés en Ile-de-France. C’est ce qu’a révélé le président de la commission médicale de l’Assistance publique-Hôpitaux de Paris (AP-HP) Rémi Salomon mardi 2 février. Des chiffres inquiétants, qui prouvent que les variants gagnent du terrain dans l’Hexagone. C’est la raison pour laquelle, depuis le 23 janvier, la Direction générale de la santé demande une seconde analyse de tous les tests PCR positifs à la Covid-19. L’objectif ? Identifier les patients contaminés par des variants du Sars-CoV-2, plus contagieux que la souche classique, et ainsi éviter une accélération de l’épidémie.

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Variants de la Covid-19 : des kits de dépistage spécifiques sont nécessaires

Pour ce faire, des kits de dépistage spécifiques sont nécessaires. Le dépistage de la Covid-19 se fait donc désormais en deux temps. Lors de la première étape, le patient réalise un test PCR classique dans un laboratoire. Le prélèvement est analysé afin de déterminer s’il est positif à la Covid-19 ou pas. Lorsque le résultat est positif, l’échantillon est ensuite envoyé à un autre laboratoire spécialisé, qui doit alors réaliser un criblage afin d’identifier la potentielle présence du variant anglais, sud-africain ou brésilien grâce à un réactif chimique spécifique.

Pour l’heure, trois kits spécifiques sont homologués : celui d’ID-Solutions, d’ABL France et d’Eurofins Biomnis. Ce dernier laboratoire est capable d’analyser jusqu’à 50.000 prélèvements par jour.

Une double analyse pour traquer les variants du virus

Certains laboratoires transmettent ainsi deux comptes-rendus à leurs patients : « Le premier, environ douze heures après le test, pour leur donner leur statut Covid. S’il est positif, ils sauront 48 heures plus tard si c’est le fait d’une mutation », explique au Parisien le médecin biologiste Arnaud Chenebit, codirecteur d’un laboratoire privé de Saint-Denis (Seine-Saint-Denis).

Mais tous les patients ne reçoivent pas forcément le résultat de ce double dépistage, selon Le Parisien. L’objectif est surtout d’en informer l’Assurance maladie pour lui permettre de contacter en priorité les personnes contaminées par les variants, désormais connus pour leur plus forte contagiosité.

Le variant britannique est le plus fréquent en France

Un procédé potentiellement contre-productif, selon certains experts : « L’essentiel est que l’information remonte dans les bases de données pour un suivi collectif. Il n’y a pas de logique individuelle à avoir. Cela influence à tort le comportement du malade selon son variant. Or, je le rappelle, il faut s’isoler et faire très attention, quelle que soit la version du virus que l’on porte ! », explique au Parisien Jean-Michel Pawlotsky, chef du pôle de biologie médicale à l’hôpital Henri-Mondor de Créteil (Val-de-Marne).

Cette double analyse a donc pour objectif premier de quantifier la présence des variants dans l’Hexagone et d’éviter une accélération de l’épidémie. Pour l’heure, « la proportion du variant britannique est plus importante que celle du variant sud-africain ou brésilien. Ces deux mutations sont tout de même identifiées dans certains prélèvements », précise à Franceinfo Sébastien Guibault, directeur général d’Eurofins Biomnis.

A terme, l’objectif est que tous les laboratoires qui réalisent des tests PCR soient en capacité de détecter les variants en même temps que la positivité ou non du prélèvement, peut-on lire sur le site du Syndicat des biologistes.

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